香蕉是全球最重要的农作物之一，随着对栽培香蕉需求的不断增加，其生产却受到多种生物和非生物因素的复杂影响。例如，香蕉的产量面临着由真菌镰刀菌引起的枯萎病的严重威胁。
因此，培育具有优良性状的新型香蕉品种，尤其是对多种病原菌具备遗传抗性的品种，对于未来的香蕉生产至关重要。而高质量的香蕉基因组无疑将推动这一基因改良的进程。
卡文迪什型香蕉（Cavendish-type banana）源自单特异性Musa acuminata (AAA)，其全球产量约占一半，因而对人类社会具有重要意义。然而，迄今为止，香蕉品种的高质量单倍型参考基因组尚未被解码。本研究首次报道了“巴西椒”（Cavendish）的端粒到端粒（T2T）和单倍型分辨参考基因组。
该参考基因组由三个单倍体组成，大小分别为477.16 Mb、477.18 Mb和469.57 Mb。基因组质量评估显示，基因组的完整性（LAI分别为19.84、20.65和20.22）和BUSCOs的完整性分别为97.40%、97.80%和93.80%。在这三个单倍体中，分别鉴定出19、17和17个端粒，重复区域的大小分别为256.48 Mb（53.76%）、258.29 Mb（54.14%）和258.84 Mb（55.13%）。
此外，从每个组装中预测到的高置信度蛋白质编码基因数量分别为37,185、37,241和37,178。尽管这三个单倍体同源性较高，但它们之间存在显著差异，序列共线性较低。在1号、4号和7号染色体中发现了多个大的反向易位。
研究结果表明，影响果实品质和香气的基因家族有所扩展，包括蔗糖/双糖/低聚糖的分解代谢、蔗糖代谢、淀粉代谢以及芳香化合物的生物合成。此外，与花药和花粉发育相关的基因家族也有所扩大，这可能与卡文迪什品种的孤雌性和不育性有关。
最后，在“八西椒”中鉴定出的抗性基因数量远少于M. acuminata，尤其是在染色体3和10上的基因簇，为香蕉抗病的分子分析提供了潜在的靶点。该T2T单倍型分辨参考基因组为香蕉的生物学研究、分子育种和遗传改良提供了宝贵的遗传资源。
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我是的签约作者“svs”！
希望本篇文章《首个端粒-端粒单倍型解析参考基因组的香蕉三倍体》能对你有所帮助！
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