作者:理查德·奥顿和威廉·弗农
分析—一种新的Covid-19变异体正在迅速传播,可能很快会成为全球的主要变体。
这种被称为XEC的变异体于8月份在德国首次被发现,与其他流行的变异相比,它似乎具备更强的传播能力——但它并不是一种全新的变异体。
XEC被称为“重组变体”。当一个人同时感染两种不同的Covid变异体时,重组现象可能会自然发生。
XEC是KS.1.1变体和KP.3.3变体之间重组的结果(两个变体之间遗传物质片段的交换)。这两个亲本变种是密切相关的,均源自JN.1,这是2024年初全球主要的变种。
XEC于2024年8月初在德国及其他一些欧洲国家首次被报告,但此后继续传播,目前在欧洲、北美和亚洲的27个国家发现了超过600例病例。
科学家们利用一个名为Gisaid的公共数据库来识别XEC病例,病毒的基因序列被上传到该数据库进行分析。正是在这里发现了SARS-CoV-2的突变(SARS-CoV-2是导致Covid的病毒)。
然而,这有点像一个醉汉在路灯下寻找他丢失的钥匙,因为那里的光线最好。换句话说,在那些通常通过常规监测对更多Covid样本进行测序的国家,发现了更多新变体病例。
截至9月18日,确诊病例最多的国家是美国(118例)、德国(92例)、英国(82例)、加拿大(77例)和丹麦(61例)。当然,在不定期对新冠病毒样本进行测序的国家,这些数字可能会更高。
目前,欧洲和北美的主要变异是KP.3.1.1,而与之密切相关的KP.3.3在亚洲占据主导地位。
XEC是一种少数变体,其在德国的患病率最高,约13%的序列是潜在的XEC。在英国,患病率约为7%,而在美国,患病率低于5%。然而,XEC似乎具备更强的传播能力,并且比其他流行变体传播得更快,这表明它将在未来几个月内成为全球的主要变体。
XEC与其亲本变体以及其他循环变体的遗传物质非常相似,这些变体主要源自JN.1。
XEC优势的一个原因可能是刺突蛋白中相对罕见的T22N突变(遗传自KS.1.1)与Q493E(来自KP.3.3)的结合。刺突蛋白是病毒与人类细胞结合的关键部分,使病毒能够进入并开始复制。然而,人们对T22N突变对病毒在人与人之间复制或传播的影响知之甚少。
但它会导致更严重的疾病吗?
我们尚未获得来自患者或实验室实验的数据来告诉我们XEC可能导致何种疾病——尽管这些数据预计很快会发布。然而,考虑到其相似的遗传信息,这种新变体在引起的疾病方面可能与其他Covid变体相似。因此,诸如高烧、咳嗽时喉咙痛、头痛、身体疼痛以及疲劳等症状是可以预见的。
由于气温较低和病毒传播加剧(由于人们更多地待在室内),冬季住院人数通常会增加。因此,这些增加在出现时,不一定与新的变异有关。
英国的秋季加强疫苗接种活动将于10月开始,届时将推出针对JN.1变种(XEC的来源)的更新疫苗,以确保对严重疾病提供良好的保护。
随着病毒的自然演变,XEC是过去和现在正在监测的新冠病毒变种中的最新一种。重组变体本身并不是什么新鲜事,因为2023年的新冠病例主要是XBB重组变体。
其他几个密切相关的变异正在被监测,比如MV.1变异,它和XEC一样,在刺突蛋白中也有T22N突变。MV.1最初于6月下旬在印度被报告,并迅速传播到其他国家,使其成为未来监测的对象。
XEC很可能成为占主导地位的全球变体,但在此之前,它可能会被超越,或者在此之后很快被一个不同但密切相关的变体所取代。
Richard Orton是格拉斯哥大学的生物信息学研究员,Wilhelm Furnon是格拉斯哥大学的病毒学博士后研究员
-本文最初由The Conversation发表。
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